公告/发布日期:2014/09/16

mile米乐m6(中国)官方网站v 成功单分子观察控制运动和记忆的受体的巧妙内部运动!

-建立用于变构药物发现的X射线测量技术-

演示要点

  • 世界上第一个视频捕捉了烟碱乙酰胆碱受体单分子的内部运动,烟碱乙酰胆碱受体是一种重要的功能蛋白,控制与运动和记忆相关的信息传输。
  • 该受体由五种蛋白质(亚基)组成,并且已证明整个受体可以通过改变每个亚基以各种方式移动。
  • 该受体的所有亚基都是药物发现的靶标,这种可以获得其内部动态信息的测量方法将成为药物发现和开发的基本测量技术,且无副作用。


演示文稿摘要

 东京大学研究生院先端科学研究生院佐佐木雄二教授领导的研究小组(产业技术综合研究所光明科学研究中心关口博史博士)药物发现分子谱研究中心,兵库大学研究生院生物科学研究生院宫泽敦夫教授,东京大学前沿科学研究生院教授冈田正人及其同事,在世界上首次成功观察到烟碱乙酰胆碱受体单个分子的三维内部运动,这种蛋白质在控制肌肉运动、记忆和记忆方面受到了广泛关注。学习,作为时间分辨率为 100 微秒、精度为皮米(原子直径长度的 1/100)的视频。

 根据两种均质蛋白质的单分子测量结果,可以确定由五个亚基组成的五聚体的内部分子运动如下异质结构和同质结构之间亚基组成的明显差异,并发现通过改变各亚基的组成可以实现各种运动。

本课题组使用的测量方法X射线单分子追踪法(衍射 X 射线跟踪:DXT)'',全部分子内部动力学主要部分的单分子视频测量结果。而且,没有副作用变构药物发现,必须获得分子内部动力学的信息,因此它有望为变构药物的发现做出贡献。

 有关此结果的详细信息,请联系自然出版集团 (自然出版集团) 电子期刊“科学报告”将在网络突发新闻版中发布。



演示内容

据说烟碱乙酰胆碱受体(nAChR)在接受神经递质乙酰胆碱(ACh)时会打开其分子结构的中心部分,诱导离子流入调节细胞兴奋性。电生理学测量表明 nAChR 诱导通道关闭、开放和脱敏状态众所周知要采取门控过程的分子机制到每个状态的转换是完全未知的。该研究小组尝试使用DXT进行分析,认为除了静态结构信息外,单个分子在各个状态下的内部动力学信息对于阐明分子机制也很重要。

 DXT将数十纳米(纳米)量级的超细金纳米晶体以化学方式附着在观察到的蛋白质分子上,并结合分子内部的运动来检测标记纳米晶体的运动X 射线/劳厄斑运动的单分子视频测量方法。以微秒为单位的时间划分。该方法是目前世界上最准确、最快的单分子视频测量方法。在这项研究中,我们用金纳米晶体标记了从射线的电器官中获得的 nAChR,该纳米晶体瞄准了 ACh 结合位点的 α 亚基,并以 100 微秒/帧的时间分辨率跟踪其运动。结果发现,两种旋转轴运动(扭转和倾斜)在 ACh 结合时被激活,而这些运动在存在抑制 ACh 与受体结合的毒素时被失活。 DXT 获得的知识基于之前的低温电子束晶体结构分析 (NUnwin 等人,JMB2012)的结果一致。

 该研究小组利用乙酰胆碱结合蛋白(AChBP)等受体蛋白的结构分析结果,确定了三维运动测量的测量位点,乙酰胆碱结合蛋白(AChBP)在nAChR的细胞外区域具有相似的氨基酸结构(同源物)。此外,在之前使用 nAChR 管状晶体的分析中讨论过的 α 亚基的旋转运动可以使用 DXT 信息重现。此外,来自DXT的信息包括时间轴信息(100微秒高速单分子追踪),使得能够比之前的报告进行更多的定量动态分析,并进一步推进与理论计算的讨论。此外,他们还发现,先前研究中无法确定的脱敏状态是由α亚基的异常运动引起的。这些结果是基于DXT数据自动分析软件的完成,该软件可以进行大量的数据分析,将大量的3D数据转换为贝叶斯推理

 这种统计信息处理的改进也显示出完全克服DXT最大缺点的可能性,即“除非金纳米晶体被标记,否则无法测量分子的内部动力学。”分子的内部运动与金纳米晶体的尺寸之间的相关性极其简单(一种线性关系,其中测量的运动随着纳米晶体的生长而减慢),通过找到这个关系表达式,可以估计分子内部运动的真实数值。当金纳米晶体没有被标记时。例如,当 ACh 被结合时,α 亚基在未标记状态下每毫秒旋转 06 度,在未结合状态下每毫秒旋转 03 度。人们发现,分子的这种微小的内部运动决定了包括钠离子在内的阳离子是否穿过细胞膜。

此外,为了实现变构药物发现,从而能够创造出无副作用的药物,获得分子内部动力学的信息至关重要,因此人们抱有很大的期望。特别是,由于构成nAChR的所有多种类型的亚基都是药物发现的靶点,我们认为这一结果极其重要。因此,最近利用DXT测量nAChR内部运动的成功是如何利用DXT轻松测量分子内部动力学信息的实例,并有望为无副作用的变构药物发现提供极为重要的基础技术。此外,DXT自动分析软件的开发仍将是重要的DXT开发技术。



术语表

◆蛋白质亚基、异质结构和同质结构
自然界中存在的许多蛋白质和酶都是由多个蛋白质组成的多聚体,组成多聚体的每个蛋白质称为亚基。多聚体蛋白质的每个亚基可以彼此相同或同源,或者不同的个体可以执行完全不同的任务。相同结构形成多聚体的多聚分子结构称为同质结构,由不同分子形成的多聚分子结构称为异质结构。[返回来源]
◆X射线单分子追踪法(衍射 X 射线跟踪; DXT
一种方法,其中用蛋白质标记几十纳米的纳米晶体,并在高速时分基础上跟踪与蛋白质内部运动相关的纳米晶体的运动,作为来自纳米晶体的X射线衍射的劳厄斑点的运动。 Yuji Sasaki教授于1997年发明了这种方法,并于2000年公布,此后测量了许多蛋白质的内部运动并发表了论文。物理评论快报、物理评论、BBRC、细胞等)。下图为本研究中使用的nAChR结构变化模型应用DXT方法的情况(a为AChBP,b为nAChR,c为DXT装置示意图)。[返回来源]
应用于本研究中使用的 nAChR 结构变化模型的 DXT 方法的插图图像
◆分子内部动力学
一般来说,内部分子动力学是蛋白质分子表达功能时发生的分子运动的总称。特别是,众所周知,本研究中的离子通道分子在与配体结合时,远离结合位点的分子中心部分发生显着变化。然而,这个信息只是通过比较运动前后的稳定结构信息来类比运动的存在。由于分子本身的内部动力学(运动)与其功能密切相关,因此迄今为止,将其视为随时间推移的真实运动一直是测量技术的挑战。此外,由于分子以离散方式运动,因此需要单分子测量来精确测量其运动,而DXT方法是世界上第一个成功的测量技术。[返回来源]
◆变构药物发现
最近引起关注的药物发现的总称。变构药物与受体活性位点以外的位点结合,通过改变受体的结构,可以巧妙地调节活性程度。变构药物有前景的一个主要原因是可以避免副作用。传统药物在不区分受体亚型的情况下附着在受体上,导致自然不会发生的反应,从而产生“副作用”。另一方面,如果变构药物属于不同亚型,则它们不具有结合位点,因此不会发生反应。通过利用这种“无效”效应,我们或许能够找到治疗药物,治疗迄今为止尚未研制出安全药物的疾病。 “变构”一词是“变构”一词的由来,是希腊语中“另一种”和“形式”的复合词。换句话说,变构效应是当分子作用于特定部位时,在另一个部位发生分子形状变化的现象。这种变化是由内部分子运动的协调高速传递现象介导的。然而,迄今为止还没有办法能够准确测量高速分子的内部运动。 DXT 使这一切成为可能。别构效应由Jacques Monod(1965年诺贝尔生理学或医学奖获得者)、Wyman、Jean-Pierre Chanjou等人提出。它还意味着分子的协同作用。[返回来源]
◆脱敏状态
指的是即使配体与通道受体结合但通道也不打开的状态。迄今为止,许多结构生物学研究人员试图确定通道受体的结构,但由于其固有的不稳定性,一直无法获得静态结构信息。目前的 DXT 结果还清楚地表明,脱敏状态是指非常具体的动态状态。有了这项研究的结果,可以说一个长久以来的梦想已经实现了。[返回来源]
◆门控过程
这显示了与通道分子中离子渗透通道的打开和关闭(门控)相关的结构变化过程,这些通道分子位于细胞表面,充当离子进出细胞的路径。到目前为止,还没有人能够直接观察到这一过程。通道分子埋藏在细胞膜(覆盖细胞的绝缘物质)中,并在分子中心具有亲水性离子渗透路径(通道孔)。通道分子的基本功能是离子渗透功能和门控过程,在单分子水平上测量这两种功能一直是迄今为止测量技术的挑战。[返回来源]
◆X射线/劳厄斑
X射线引起的衍射现象之一。例如,当使用X射线背反射法用白色X射线照射单晶时,在X射线胶片上满足布拉格角的位置周期性地出现劳厄斑点。当使用单色 X 射线时,称为布拉格反射。 2014年是马克斯·西奥多·费利克斯·冯·劳厄获得诺贝尔物理学奖100周年,因此世界各地都在举办世界晶体年的庆祝活动。[返回来源]
◆贝叶斯推理
所有分子内部运动均服从正态(高斯)分布。然而,在某些情况下,几种类型(几件)可能会重叠,并且数量往往是未知的。解决这一问题的关键技术之一是贝叶斯推理。[返回来源]



联系我们

查询表